RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481995.5

HOXB-AS3-211, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 523 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SNAP23O00161 211 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TLR2O60603 784 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CETPP11597 493 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IL1R1P14778 569 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CEP85Q6P2H3 762 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AOX1Q06278 1338 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RAET1EQ8TD07 263 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-211ENST00000481995 POLA2Q14181 598 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MTFR1Q15390 333 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SSH3Q8TE77 659 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HOXD10P28358 340 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ATP8B2P98198 1209 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SNAPC2Q13487 334 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SHISA4Q96DD7 197 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SZT2Q5T011 3432 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GRK4P32298 578 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ERO1BQ86YB8 467 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BTBD19C9JJ37 291 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PSMC4P43686 418 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 UBXN2AP68543 259 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TRIM47Q96LD4 638 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TEPSINQ96N21 525 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WRNIP1Q96S55 665 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RNF208Q9H0X6 261 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SRRDQ9UH36 339 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCL5P13501 91 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HOOK2Q96ED9 719 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COPRSQ9NQ92 184 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CPA4Q9UI42 421 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MYPNQ86TC9 1320 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GJB1P08034 283 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CRKP46108 304 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GJA8P48165 433 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-211ENST00000481995 A0A1W2PPC1 479 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IRF6O14896 467 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SRGAP3O43295 1099 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EVI5O60447 810 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 OSBPP22059 807 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPIL2Q13356 520 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FBXO3Q9UK99 471 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CACNB3P54284 484 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DCAF15Q66K64 600 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C17orf99Q6UX52 265 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 VPS37DQ86XT2 251 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PDHXO00330 501 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CIAO1O76071 339 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GYG1P46976 350 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPATQ06203 517 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PRO3102Q9H379 93 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HMMRO75330 724 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CTGFP29279 349 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FCGRTP55899 365 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms