RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 FAM83AQ86UY5 434 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 USP40Q9NVE5 1235 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K11Q16584 847 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 BCL11AQ9H165 835 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K2P36507 400 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 NFIAQ12857 509 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 CCDC102AQ96A19 550 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 ZIC5Q96T25 663 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 LDHCP07864 332 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A3P09131 477 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 BTDP43251 543 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 GSTO1P78417 241 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 WBP1LQ9NX94 342 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 NOGQ13253 232 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 FAM151AQ8WW52 585 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 IDI2Q9BXS1 227 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-211ENST00000480301 PCNTO95613 3336 aa25.58■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 IGSF3O75054 1194 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 RHBDL3P58872 404 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 TCP10Q12799 353 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 AAMPQ13685 434 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 UNCXA6NJT0 531 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 ATP5JP18859 108 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 RGS3P49796 1198 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD3O75355 529 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-211ENST00000480301 FOXN1O15353 648 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 PPP4CP60510 307 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 HOOK2Q96ED9 719 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 CYP7A1P22680 504 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 AIDAQ96BJ3 306 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 CSRNP1Q96S65 589 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.673e-17■□□□□ 10.5
ACTB-211ENST00000480301 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 GOLIM4O00461 696 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 BAG3O95817 575 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K9P80192 1104 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K12Q12852 859 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 PICALMQ13492 652 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 SPRYD7Q5W111 196 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 DCAF15Q66K64 600 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 TEX11Q8IYF3 940 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 HAUS7Q99871 368 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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