RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM177BA6PVY3 158 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 F8W735 103 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 H3BRJ5 948 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PAGE1O75459 146 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TGFB1P01137 390 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RAXQ9Y2V3 346 aa5.39□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 F6X3S4 739 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 IGLV1-40P01703 118 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RLBP1P12271 317 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 LIG3P49916 1009 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 CABP4P57796 275 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 IKBKEQ14164 716 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 MAP3K11Q16584 847 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PHC3Q8NDX5 983 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TINF2Q9BSI4 451 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PPME1Q9Y570 386 aa5.38□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GLB1P16278 677 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 CDC25BP30305 580 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PWP1Q13610 501 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 HGSNATQ68CP4 663 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RELL1Q8IUW5 271 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RHOVQ96L33 236 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM74Q96NL1 305 aa5.37□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 LINC01387J3KSC0 135 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GRIK1P39086 918 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TNNI2P48788 182 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PIP4K2BP78356 416 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 RASIP1Q5U651 963 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 Q6ZS46 218 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SULF2Q8IWU5 870 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 STK35Q8TDR2 534 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 WNT8BQ93098 351 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 STOML1Q9UBI4 398 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.36□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.36□□□□□ -1.55
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SUPT20H-215ENST00000478911 ADAMTS4O75173 837 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SPINK2P20155 84 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 BMP6P22004 513 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 NME2P22392 152 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SAMM50Q9Y512 469 aa5.35□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TM4SF5O14894 197 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 FSCN2O14926 492 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PF4P02776 101 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GARTP22102 1010 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ARNTP27540 789 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 GJA8P48165 433 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 AP3B2Q13367 1082 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SETDB1Q15047 1291 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 PDZD3Q86UT5 571 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 SPON2Q9BUD6 331 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 CAPN10Q9HC96 672 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.34□□□□□ -1.55
SUPT20H-215ENST00000478911 ARL4DP49703 201 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 GSTM4Q03013 218 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 LMNB2Q03252 620 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 PAK2Q13177 524 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.33□□□□□ -1.56
SUPT20H-215ENST00000478911 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.33□□□□□ -1.56
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