RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 MECOMQ03112 1051 aa24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 FAM83AQ86UY5 434 aa24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 TEPSINQ96N21 525 aa24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.37■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 SLC10A3P09131 477 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 AIDAQ96BJ3 306 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 USP40Q9NVE5 1235 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 RAI14Q9P0K7 980 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 FZD1Q9UP38 647 aa24.36■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.35■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 CRBNQ96SW2 442 aa24.35■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 GSTO1P78417 241 aa24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K11Q16584 847 aa24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF384Q8TF68 577 aa24.34■■□□□ 1.49
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CTPS1-206ENST00000470271 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.34■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 LDHCP07864 332 aa24.33■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 ZAP70P43403 619 aa24.33■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 ZIC5Q96T25 663 aa24.33■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 BCL11AQ9H165 835 aa24.33■■□□□ 1.49
CTPS1-206ENST00000470271 FOXN1O15353 648 aa24.32■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 BTDP43251 543 aa24.32■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.32■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.32■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 NFIAQ12857 509 aa24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 FAM151AQ8WW52 585 aa24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 DCTPP1Q9H773 170 aa24.31■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 UNCXA6NJT0 531 aa24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 IGSF3O75054 1194 aa24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 TCP10Q12799 353 aa24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 HOOK2Q96ED9 719 aa24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.3■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 IDI2Q9BXS1 227 aa24.29■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.28■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.28■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.27■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 RGS3P49796 1198 aa24.27■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.27■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.27■■□□□ 1.48
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CTPS1-206ENST00000470271 AK9Q5TCS8 1911 aa24.27■■□□□ 1.48
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ENTPD3O75355 529 aa24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 RHBDL3P58872 404 aa24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.26■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 CA12O43570 354 aa24.25■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF15Q66K64 600 aa24.25■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 CSRNP1Q96S65 589 aa24.25■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.25■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 BAG3O95817 575 aa24.24■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 SPRYD7Q5W111 196 aa24.24■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.24■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K9P80192 1104 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K12Q12852 859 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 PICALMQ13492 652 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 AAMPQ13685 434 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 OTOFQ9HC10 1997 aa24.23■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ATP5JP18859 108 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 LBX1P52954 281 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 WNK4Q96J92 1243 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 CSADQ9Y600 493 aa24.22■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTPS1-206ENST00000470271 PLCG2P16885 1265 aa24.21■■□□□ 1.47
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