RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 OPTNQ96CV9 577 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 OTOFQ9HC10 1997 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 SEMA3EO15041 775 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 MAP3K9P80192 1104 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 VGLL4Q14135 290 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 FAM83AQ86UY5 434 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 XAGE2Q96GT9 111 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 ALDH1A1P00352 501 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 RASGRF1Q13972 1273 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 PTPN18Q99952 460 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 NFIAQ12857 509 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 FKTNO75072 461 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 MS4A1P11836 297 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 TCP10Q12799 353 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 USP40Q9NVE5 1235 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ABCF2Q9UG63 623 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 CSADQ9Y600 493 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 RGS19P49795 217 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
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HPS1-207ENST00000465957 OTUD5Q96G74 571 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 WRNIP1Q96S55 665 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZBTB22O15209 634 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 LAMB1P07942 1786 aa20.11■□□□□ 0.81
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HPS1-207ENST00000465957 POLA2Q14181 598 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 PDE3AQ14432 1141 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 PI16Q6UXB8 463 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 HOOK2Q96ED9 719 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.09■□□□□ 0.81
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HPS1-207ENST00000465957 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 CCL15Q16663 113 aa20.09■□□□□ 0.81
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HPS1-207ENST00000465957 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 CEP85Q6P2H3 762 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.09■□□□□ 0.81
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HPS1-207ENST00000465957 SSH3Q8TE77 659 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS1-207ENST00000465957 GAKO14976 1311 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 GTF2A2P52657 109 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 ERO1BQ86YB8 467 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SPATA5Q8NB90 893 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 ZNF384Q8TF68 577 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.07■□□□□ 0.8
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HPS1-207ENST00000465957 RGS3P49796 1198 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 MECOMQ03112 1051 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 HTTP42858 3142 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 BTDP43251 543 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 AK9Q5TCS8 1911 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 MCAMP43121 646 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SLF2Q8IX21 1173 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-207ENST00000465957 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.04■□□□□ 0.8
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