RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465311.1

ZNF41-204, Transcript of zinc finger protein 41, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF41, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF41-204ENST00000465311 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.09■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 MECOMQ03112 1051 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 NFIAQ12857 509 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 AACSQ86V21 672 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.08■■□□□ 1.13
ZNF41-204ENST00000465311 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 FAM83AQ86UY5 434 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 TSKSQ9UJT2 592 aa22.07■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 USP40Q9NVE5 1235 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 ZAP70P43403 619 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 LBX1P52954 281 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 CSRNP1Q96S65 589 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 RAI14Q9P0K7 980 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 BTDP43251 543 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 TCP10Q12799 353 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 RAB11FIP3O75154 756 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 SLF2Q8IX21 1173 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 FAM151AQ8WW52 585 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 SPRYD7Q5W111 196 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 BCL11AQ9H165 835 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF41-204ENST00000465311 RHBDL3P58872 404 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 CRBNQ96SW2 442 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 IDI2Q9BXS1 227 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.01■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 CA12O43570 354 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 GJA5P36382 358 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 RGS3P49796 1198 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 GSTO1P78417 241 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 WNK4Q96J92 1243 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 RNF186Q9NXI6 227 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.99■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 UNCXA6NJT0 531 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 LDHCP07864 332 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 MAP3K9P80192 1104 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 VGLL4Q14135 290 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ELP3Q9H9T3 547 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 OTOFQ9HC10 1997 aa21.98■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ENTPD3O75355 529 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 TRPA1O75762 1119 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 PICALMQ13492 652 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 WRNIP1Q96S55 665 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.97■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.96■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 DCTPP1Q9H773 170 aa21.96■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.96■■□□□ 1.11
ZNF41-204ENST00000465311 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 TM4SF4P48230 202 aa21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 DCAF15Q66K64 600 aa21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 HOOK2Q96ED9 719 aa21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.95■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.94■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ZNF41-204ENST00000465311 SLURP2P0DP57 97 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms