RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 USP40Q9NVE5 1235 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 CSADQ9Y600 493 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 FKTNO75072 461 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 MS4A1P11836 297 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 RGS19P49795 217 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 CACNB3P54284 484 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 POLA2Q14181 598 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 SSH3Q8TE77 659 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 OPTNQ96CV9 577 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ELP3Q9H9T3 547 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GPR108Q9NPR9 543 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ABCF2Q9UG63 623 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 LDHCP07864 332 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GJA5P36382 358 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GTF2A2P52657 109 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 RASGRF1Q13972 1273 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 VGLL4Q14135 290 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ERO1BQ86YB8 467 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 IDI2Q9BXS1 227 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 LAMB1P07942 1786 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF3O75054 1194 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ENTPD3O75355 529 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GSTO1P78417 241 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 TCP10Q12799 353 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 SPATA5Q8NB90 893 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 WRNIP1Q96S55 665 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 PTPN18Q99952 460 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GAKO14976 1311 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-210ENST00000463041 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CETPP11597 493 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 RLBP1P12271 317 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 PPATQ06203 517 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 NFIAQ12857 509 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 OTOFQ9HC10 1997 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 RGS3P49796 1198 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 SP3Q02447 781 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 MAP3K10Q02779 954 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 MECOMQ03112 1051 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 PPIL2Q13356 520 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 SNAPC2Q13487 334 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGEF6Q15052 776 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CCL15Q16663 113 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 TNNI3KQ59H18 835 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 OTUD5Q96G74 571 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ERO1AQ96HE7 468 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRF-210ENST00000463041 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 IRF6O14896 467 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 INPP5BP32019 993 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 MCAMP43121 646 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 BTDP43251 543 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 CRHR2Q13324 411 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRF-210ENST00000463041 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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