RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, human

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRIP1-204	ENST00000460900	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CRIP1-204	ENST00000460900	GAK	O14976	1311 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	ZAP70	P43403	619 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	GSTO1	P78417	241 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	LDHC	P07864	332 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	NOG	Q13253	232 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	TEPSIN	Q96N21	525 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	SLC10A3	P09131	477 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	BTD	P43251	543 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	IGSF3	O75054	1194 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CRIP1-204	ENST00000460900	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	TCP10	Q12799	353 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	NFIA	Q12857	509 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	AAMP	Q13685	434 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	HOOK2	Q96ED9	719 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	RGS3	P49796	1198 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	ENTPD3	O75355	529 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	BAG3	O95817	575 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	RHBDL3	P58872	404 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CRIP1-204	ENST00000460900	FOXN1	O15353	648 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	ATP5J	P18859	108 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	PICALM	Q13492	652 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	CYP7A1	P22680	504 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	GOLIM4	O00461	696 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	PLCG2	P16885	1265 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	PPP4C	P60510	307 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	CSRNP1	Q96S65	589 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CRIP1-204	ENST00000460900	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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