RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 E9PCH4 1651 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 SFI1A8K8P3 1242 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP1A2P50993 1020 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 GRIK4Q16099 956 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC102BQ68D86 513 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0G2JLW4 131 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 GLTPD2A6NH11 291 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 DYRK3O43781 588 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 NID1P14543 1247 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 GRM1Q13255 1194 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 LTBP1Q14766 1721 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-203ENST00000459697 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 RASSF10A6NK89 507 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOC5O00471 708 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 LILRB5O75023 590 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 VCANP13611 3396 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 C9orf172C9J069 976 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 RAD21O60216 631 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN10P78369 228 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SMIM5Q71RC9 77 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 BHMTQ93088 406 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SUSD3Q96L08 255 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX27Q96L92 541 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 COL18A1P39060 1754 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PASKQ96RG2 1323 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L3A6NCW0 530 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L4A6NCW7 530 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 TYRO3Q06418 890 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 POM121Q96HA1 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFLR1Q9H665 355 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R2N6 131 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PLA2G5P39877 138 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 OGFOD1Q8N543 542 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 CACNA1AO00555 2505 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 TGFB2P61812 414 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM122AQ96E09 287 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPNS2Q96L46 248 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 SBF1O95248 1867 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0A0MRY4 1105 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 POM121CA8CG34 1229 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 CA12O43570 354 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ELNP15502 786 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 DPEP1P16444 411 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 RAC1P63000 192 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRE1Q14246 886 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 HIF1AQ16665 826 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 ARTNQ5T4W7 220 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-203ENST00000459697 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms