RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 TCP10Q12799 353 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC158Q5M9N0 1113 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 SPRYD7Q5W111 196 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 FAM83AQ86UY5 434 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 SAGE1Q9NXZ1 904 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 MYH2Q9UKX2 1941 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB22O15209 634 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 MCAMP43121 646 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 C20orf194Q5TEA3 1177 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP1CQ5VVH2 108 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-210ENST00000440825 SLF2Q8IX21 1173 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 SNRKQ9NRH2 765 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 WNK4Q96J92 1243 aa34.06■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 ELP3Q9H9T3 547 aa34.06■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 RAI14Q9P0K7 980 aa34.06■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 MECOMQ03112 1051 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 SREBF2Q12772 1141 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 NFIAQ12857 509 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 BCL11AQ9H165 835 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 OTOFQ9HC10 1997 aa34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 APBB1O00213 710 aa34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 ERC1Q8IUD2 1116 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 FAM151AQ8WW52 585 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 LRP2BPQ9P2M1 347 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 GAKO14976 1311 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 UNCXA6NJT0 531 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 BTDP43251 543 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 MIGA2Q7L4E1 593 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 HOOK2Q96ED9 719 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 AK9Q5TCS8 1911 aa34.01■■■■□ 3.04
FAAP20-210ENST00000440825 HMMRO75330 724 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 TM4SF4P48230 202 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K9P80192 1104 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 PDE3AQ14432 1141 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 FAM198AQ9UFP1 575 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 CSADQ9Y600 493 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 VGLL4Q14135 290 aa34■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa34■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 WRNIP1Q96S55 665 aa34■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D8O95759 1140 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 GJA5P36382 358 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 GSTO1P78417 241 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF15Q66K64 600 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 AACSQ86V21 672 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.031e-7■■□□□ 12.2
FAAP20-210ENST00000440825 OPTNQ96CV9 577 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 RGS3P49796 1198 aa33.98■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZFPM1Q8IX07 1006 aa33.98■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 PICALMQ13492 652 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 SIRT2Q8IXJ6 389 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF384Q8TF68 577 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 LDHCP07864 332 aa33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 RHPN1Q8TCX5 695 aa33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZAP70P43403 619 aa33.95■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 OTUD5Q96G74 571 aa33.95■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF341Q9BYN7 854 aa33.95■■■■□ 3.03
FAAP20-210ENST00000440825 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 INHBEP58166 350 aa33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 IDI2Q9BXS1 227 aa33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 DGKZQ13574 1117 aa33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 IFNL1Q8IU54 200 aa33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 KIF1BPQ96EK5 621 aa33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 ENTPD3O75355 529 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 INPP5BP32019 993 aa33.9■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.02
FAAP20-210ENST00000440825 RHBDL3P58872 404 aa33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms