RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 AIDAQ96BJ3 306 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 RGPD5Q99666 1765 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 SHC4Q6S5L8 630 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 MTMR7Q9Y216 660 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 H7C1W4 665 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 SLFN14P0C7P3 912 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 MYL5Q02045 173 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 TERF2Q15554 542 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 VGLL3A8MV65 326 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB43O43298 467 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 CASP7P55210 303 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE4BQ07343 736 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 CACNA1FO60840 1977 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-202ENST00000440289 PALLDQ8WX93 1383 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NEK11Q8NG66 645 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 EVCP57679 992 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NCAPHQ15003 741 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 APPBP2Q92624 585 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 GUCY1A2P33402 732 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MCAMP43121 646 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NR5A1Q13285 461 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC102BQ68D86 513 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXP2O15409 715 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR3EQ9NVU0 708 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 YEATS4O95619 227 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MTF1Q14872 753 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 GREM2Q9H772 168 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SALL1Q9NSC2 1324 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTSL3P82987 1691 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ARMT1Q9H993 441 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 PRR29P0C7W0 189 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NAPBQ9H115 298 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQ27 194 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQ64 194 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQD8 194 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKAB2O43741 272 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 CMA1P23946 247 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 PHKA1P46020 1223 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 USP49Q70CQ1 688 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 BRAPQ7Z569 592 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGA6P23229 1130 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 TDO2P48775 406 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 WDR24Q96S15 920 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 EVA1CP58658 441 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A14Q15043 492 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 JMYQ8N9B5 988 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 DHX58Q96C10 678 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 CASQ1P31415 396 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 APOA5Q6Q788 366 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 NEDD4P46934 1319 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A0U1RQJ8 604 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCF2Q9UG63 623 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-202ENST00000440289 MBD4O95243 580 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms