RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BTDP43251 543 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SKAP1Q86WV1 359 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SULF1Q8IWU6 871 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LNPKQ9C0E8 428 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKG1Q13976 671 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMC5Q8IY18 1101 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.5□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RHBDL3P58872 404 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RASA3Q14644 834 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TEPSINQ96N21 525 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CREBZFQ9NS37 354 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP5JP18859 108 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE4AP27815 886 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TCP10Q12799 353 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HAUS7Q99871 368 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LAMA4Q16363 1823 aa11.48□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYO1BO43795 1136 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE6AP16499 860 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MX1P20591 662 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP7A1P22680 504 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RGS3P49796 1198 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRM1Q13255 1194 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PICALMQ13492 652 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GCC1Q96CN9 775 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP40Q9NVE5 1235 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EVX2Q03828 476 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZIC5Q96T25 663 aa11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.46□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RASSF10A6NK89 507 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM196BA6NMK8 535 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AOC2O75106 756 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VEGFBP49765 207 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMP14P50281 582 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HUNKP57058 714 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUCB1Q02818 461 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AAMPQ13685 434 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLRG1Q96E93 195 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.45□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FLT1P17948 1338 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADD2P35612 726 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE1AP54750 535 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms