RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 FCGRTP55899 365 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 TIAF1O95411 115 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 GSTM4Q03013 218 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 MRS2Q9HD23 443 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 WDR64B1ANS9 1081 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SPINK2P20155 84 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SHISA5Q8N114 240 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 ZNF576Q9H609 170 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 RXRBP28702 533 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 MCTP1Q6DN14 999 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 FAM161BQ96MY7 647 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 CTSBP07858 339 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 USP17L7P0C7H9 530 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 VAMP1P23763 118 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 GRIK1P39086 918 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 PCDH1Q08174 1060 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 DTX1Q86Y01 620 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 FBXL6Q8N531 539 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 USP31Q70CQ4 1352 aa6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 F13BP05160 661 aa6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.59□□□□□ -1.35
TRDN-203ENST00000422596 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.59□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ECEL1O95672 775 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 B3GALT4O96024 378 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 CTSHP09668 335 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 MAOBP27338 520 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 USP11P51784 963 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 NFKBIBQ15653 356 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 CEP44Q9C0F1 390 aa6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ADMP35318 185 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 FAAP100Q0VG06 881 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 CRELD1Q96HD1 420 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 UNCXA6NJT0 531 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ADH5P11766 374 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 IRAK1P51617 712 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 SV2BQ7L1I2 683 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ATG3Q9NT62 314 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 PIM2Q9P1W9 311 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 SMARCA4P51532 1647 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 POU4F3Q15319 338 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 PAOXQ6QHF9 649 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 BACH2Q9BYV9 841 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 WNT11O96014 354 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 CYP11A1P05108 521 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 AP3B2Q13367 1082 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-203ENST00000422596 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.54□□□□□ -1.36
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