RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POTEFA5A3E0 1075 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BACH1O14867 736 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GREM1O60565 184 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RFPL3O75679 317 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDAH1O94760 285 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHKG2P15735 406 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GIPRP48546 466 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STRN3Q13033 797 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GRIN2CQ14957 1233 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAP3K11Q16584 847 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TBCELQ5QJ74 424 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXW10Q5XX13 1052 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EEPD1Q7L9B9 569 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPR152Q8TDT2 470 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOLGA1Q92805 767 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYO19Q96H55 970 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CRBNQ96SW2 442 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCO2Q9BYV7 579 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 B2RBV5 119 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 F5H423 210 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MICAL2O94851 1124 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 JUNDP17535 347 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GARTP22102 1010 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PTPREP23469 700 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CRKP46108 304 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WASHC5Q12768 1159 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GRM3Q14832 879 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KRT72Q14CN4 511 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SEPT2Q15019 361 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ELF2Q15723 593 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SEZ6Q53EL9 994 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DACT2Q5SW24 774 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC9A9Q8IVB4 645 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLITRK4Q8IW52 837 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OR8H2Q8N162 312 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NGLY1Q96IV0 654 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RHOVQ96L33 236 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CENPOQ9BU64 300 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCL2L12Q9HB09 334 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ACAD8Q9UKU7 415 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DMTF1Q9Y222 760 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POTECB2RU33 542 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GABRDO14764 452 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PMM2O15305 246 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPR39O43194 453 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PF4P02776 101 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCNYL3P0C7X3 344 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC5A1P13866 664 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GSTT1P30711 240 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DEKP35659 375 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCT5P48643 541 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SCNN1DP51172 638 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GTF2A2P52657 109 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GDF10P55107 478 aa3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms