RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRN2-204ENST00000404321 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN2-204ENST00000404321 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN2-204ENST00000404321 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN2-204ENST00000404321 USP40Q9NVE5 1235 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRN2-204ENST00000404321 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF384Q8TF68 577 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRN2-204ENST00000404321 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN2-204ENST00000404321 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRN2-204ENST00000404321 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM83AQ86UY5 434 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 ZAP70P43403 619 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 FAM151AQ8WW52 585 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 CA12O43570 354 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 TRPA1O75762 1119 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 SPRYD7Q5W111 196 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 ELP3Q9H9T3 547 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 RNF186Q9NXI6 227 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 RGS3P49796 1198 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 GSTO1P78417 241 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 TNS4Q8IZW8 715 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 WNK4Q96J92 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2-204ENST00000404321 RAB11FIP3O75154 756 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 LDHCP07864 332 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 GJA5P36382 358 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 RHBDL3P58872 404 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K9P80192 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 WRNIP1Q96S55 665 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 CRBNQ96SW2 442 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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PTPRN2-204ENST00000404321 IDI2Q9BXS1 227 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 CSADQ9Y600 493 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRN2-204ENST00000404321 UNCXA6NJT0 531 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF15Q66K64 600 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRN2-204ENST00000404321 OPTNQ96CV9 577 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 ENTPD3O75355 529 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SREBF2Q12772 1141 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SLURP2P0DP57 97 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 TM4SF4P48230 202 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 TEX11Q8IYF3 940 aa22.16■■□□□ 1.14
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