RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.89■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.89■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF186Q9NXI6 227 aa24.89■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.89■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPA1O75762 1119 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 MCAMP43121 646 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SPRYD7Q5W111 196 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 USP40Q9NVE5 1235 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 UNCXA6NJT0 531 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE3AQ14432 1141 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 GAKO14976 1311 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 AK9Q5TCS8 1911 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SLF2Q8IX21 1173 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 MECOMQ03112 1051 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TCP10Q12799 353 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 NFIAQ12857 509 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 WNK4Q96J92 1243 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM151AQ8WW52 585 aa24.84■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SNRKQ9NRH2 765 aa24.84■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 HMMRO75330 724 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 TM4SF4P48230 202 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SREBF2Q12772 1141 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 HOOK2Q96ED9 719 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 ELP3Q9H9T3 547 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 RAI14Q9P0K7 980 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD39-201ENST00000393537 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.83■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 BTDP43251 543 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K9P80192 1104 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF384Q8TF68 577 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMB1P07942 1786 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.81■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 GJA5P36382 358 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 GSTO1P78417 241 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 VGLL4Q14135 290 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF15Q66K64 600 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 AACSQ86V21 672 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 CSADQ9Y600 493 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 APBB1O00213 710 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN15O75808 1086 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 LDHCP07864 332 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS3P49796 1198 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 OPTNQ96CV9 577 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 IDI2Q9BXS1 227 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 WRNIP1Q96S55 665 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 DOCK2Q92608 1830 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ENTPD3O75355 529 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D8O95759 1140 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZAP70P43403 619 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD39-201ENST00000393537 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 INHBEP58166 350 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 RHBDL3P58872 404 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 PICALMQ13492 652 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNL1Q8IU54 200 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 OTUD5Q96G74 571 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL11AQ9H165 835 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms