RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 FSIP1Q8NA03 581 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 M0R2C6 588 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 BIN1O00499 593 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 HOMER1Q86YM7 354 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CFAP45Q9UL16 551 aa17.57■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 MAST3O60307 1309 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 A0A1B0GVL5 298 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TOM1O60784 492 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PTPN21Q16825 1174 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ISM2Q6H9L7 571 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 E7EWF7 191 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 KINO60870 393 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CTSWP56202 376 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa17.56■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 MYO1CO00159 1063 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC158Q5M9N0 1113 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 UBXN4Q92575 508 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 JAG2Q9Y219 1238 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TJP1Q07157 1748 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ZSCAN26Q16670 478 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 OSBP2Q969R2 916 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.55■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 IDH1O75874 414 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 OAS2P29728 719 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CDC25BP30305 580 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PHKA1P46020 1223 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TPM4P67936 248 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SARM1Q6SZW1 724 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NBPF11Q86T75 865 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 RGS22Q8NE09 1264 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.43e-6■■□□□ 14
ZBED1-201ENST00000381218 SLIT2O94813 1529 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NEMFO60524 1076 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TXLNBQ8N3L3 684 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SDF4Q9BRK5 362 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 GJB4Q9NTQ9 266 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 DNAI1Q9UI46 699 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SMC2O95347 1197 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 MCAMP43121 646 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 RCOR1Q9UKL0 485 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 PHLPP1O60346 1717 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 INCENPQ9NQS7 918 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 FAM193AP78312 1265 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TOMM22Q9NS69 142 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 TMC6Q7Z403 805 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 MNS1Q8NEH6 495 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 FBXO3Q9UK99 471 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-201ENST00000381218 SASH3O75995 380 aa17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 LMAN1P49257 510 aa17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 EIF5P55010 431 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 URI1O94763 535 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 FAM160A1Q05DH4 1040 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 CEP57L1Q8IYX8 460 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 ANO10Q9NW15 660 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 IFNKQ9P0W0 207 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 PCDHA7Q9UN72 937 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 NDUFA8P51970 172 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-201ENST00000381218 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms