RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356825.8

SMAD2-202, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD2, Length 10,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-202ENST00000356825 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CHRNA2Q15822 529 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SV2BQ7L1I2 683 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TCIRG1Q13488 830 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PTPDC1A2A3K4 754 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 P4HA1P13674 534 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 DNM2P50570 870 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 VWA3BQ502W6 1294 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 KIF11P52732 1056 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 VCX3BQ9H321 246 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SPOPO43791 374 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 NR1I2O75469 434 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 KRT222Q8N1A0 295 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 VCXQ9H320 206 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 IL2RBP14784 551 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CNBD1Q8NA66 436 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GINS2Q9Y248 185 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 AZI2Q9H6S1 392 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 MAST3O60307 1309 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CETN3O15182 167 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CHMP2AO43633 222 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CEP120Q8N960 986 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ZEB2O60315 1214 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 MBIPQ9NS73 344 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TNRQ92752 1358 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SKILP12757 684 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 I3L4J1 428 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CASC4Q6P4E1 433 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ATP2A3Q93084 1043 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SPTLC2O15270 562 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 BRAPQ7Z569 592 aa16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GBP1P32455 592 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PPP2R5CQ13362 524 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GNPATO15228 680 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PPP1R2P41236 205 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 BRF1Q92994 677 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TUBB4AP04350 444 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CNGA4Q8IV77 575 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PPP2R5DQ14738 602 aa16.04■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 ACEP12821 1306 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 DNAI1Q9UI46 699 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 IL16Q14005 1332 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 IQUBQ8NA54 791 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TTC6Q86TZ1 520 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.03■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 KIF22Q14807 665 aa16.02■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 CEP57Q86XR8 500 aa16.02■□□□□ 0.16
SMAD2-202ENST00000356825 NECAB1Q8N987 351 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms