RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 HACD3Q9P035 362 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TNNQ9UQP3 1299 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 MROH2AA6NES4 1674 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SIL1Q9H173 461 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IQGAP1P46940 1657 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DYTNA2CJ06 578 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FAM177BA6PVY3 158 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PAK2Q13177 524 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CUL5Q93034 780 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF5Q96JK2 942 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 KIF2CQ99661 725 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PDE4BQ07343 736 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SYCE3A1L190 88 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ISM2Q6H9L7 571 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LZICQ8WZA0 190 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IWS1Q96ST2 819 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CLTCL1P53675 1640 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GAS8O95995 478 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1AP38606 617 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf20Q8ND61 904 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NCOA7Q8NI08 942 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 STMN2Q93045 179 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PLCD1P51178 756 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 KIFAP3Q92845 792 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 UBL4BQ8N7F7 174 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LAD1O00515 517 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ITIH3Q06033 890 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC4Q96A65 974 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RAI14Q9P0K7 980 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PLIN1O60240 522 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GMNNO75496 209 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SLAIN2Q9P270 581 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 H0YCG3 227 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ANXA13P27216 316 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO41Q8TF61 875 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAML3Q96JK9 1138 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BATF3Q9NR55 127 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NPATQ14207 1427 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NCAPD2Q15021 1401 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SRGAP3O43295 1099 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 UBASH3AP57075 661 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NR1H3Q13133 447 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RABGGTAQ92696 567 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 HOOK2Q96ED9 719 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM51Q9NW97 253 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ATP10DQ9P241 1426 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC1Q9NV70 894 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms