RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 FNBP1Q96RU3 617 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 OPA1O60313 960 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA4P34932 840 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KCNA6P17658 529 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 XAGE2Q96GT9 111 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM1O75626 825 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB16Q05516 673 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TNNI3KQ59H18 835 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC16Q9P2K2 825 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TLDC2A0PJX2 215 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 SH2D4AQ9H788 454 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 GGA1Q9UJY5 639 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH11Q8N954 259 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KB1P23443 525 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PDE4DQ08499 809 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 WDR44Q5JSH3 913 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KRT222Q8N1A0 295 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 GINS2Q9Y248 185 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 RASA3Q14644 834 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF790Q6PG37 636 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TXKP42681 527 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 USP26Q9BXU7 913 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 STK32BQ9NY57 414 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ELP1O95163 1332 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 EYA2O00167 538 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 RAD50Q92878 1312 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SLC27A2O14975 620 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NOD1Q9Y239 953 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TCP10Q12799 353 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 USH1GQ495M9 461 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 VPS16Q9H269 839 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 RNF34Q969K3 372 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 MSL1Q68DK7 614 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 PDE8AO60658 829 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 TRPM2O94759 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 MYL10Q9BUA6 226 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP58Q5T655 872 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 A1BGP04217 495 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ATP10BO94823 1461 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DEXIO95424 95 aa25.1■■□□□ 1.61
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PTPRM-201ENST00000332175 ZFYVE9O95405 1425 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.1■■□□□ 1.61
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PTPRM-201ENST00000332175 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 VPS18Q9P253 973 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZEB2O60315 1214 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 DTNBO60941 627 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 PLCD1P51178 756 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 FAM227BQ96M60 508 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 SMC6Q96SB8 1091 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 LGR6Q9HBX8 967 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-201ENST00000332175 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
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