RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261590.12

DSG2-201, Transcript of desmoglein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DSG2, Length 5,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2-201ENST00000261590 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.94■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.94■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 FNBP1Q96RU3 617 aa24.94■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 ELP1O95163 1332 aa24.94■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 SIRT1Q96EB6 747 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 RNF34Q969K3 372 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 I3L4J1 428 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.93■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 TRPC3Q13507 836 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 CROCCP2Q86T23 111 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 VPS16Q9H269 839 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 BACH1O14867 736 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PPARDQ03181 441 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 LIN9Q5TKA1 542 aa24.92■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 ASIC2Q16515 512 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 CARD6Q9BX69 1037 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 A0A1B0GVL5 298 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 STMN1P16949 149 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 GNAT2P19087 354 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PPP2R5DQ14738 602 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 SP4Q02446 784 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PPP1R2P41236 205 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 NOX5Q96PH1 765 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.91■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 DAPK3O43293 454 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 MGEA5O60502 916 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 SLC8A3P57103 927 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 PPP2R5CQ13362 524 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 CUL4BQ13620 913 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.9■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 WHAMMQ8TF30 809 aa24.89■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 IL16Q14005 1332 aa24.89■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.89■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.89■■□□□ 1.58
DSG2-201ENST00000261590 RXRAP19793 462 aa24.89■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.89■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.89■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ELF2Q15723 593 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 OGFOD1Q8N543 542 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ZNF174Q15697 407 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 PDE4DQ08499 809 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 PRR16Q569H4 304 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 GBP5Q96PP8 586 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.88■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 VCX3AQ9NNX9 186 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 LGSNQ5TDP6 509 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 FOXO3O43524 673 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ATP8B2P98198 1209 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 RUFY3Q7L099 469 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 PLCD1P51178 756 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 KRT15P19012 456 aa24.87■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 SMC5Q8IY18 1101 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 CEP104O60308 925 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 PAK2Q13177 524 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.86■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 GRM8O00222 908 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 LETM2Q2VYF4 491 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 ATL3Q6DD88 541 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 GABPAQ06546 454 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms