RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS12P25398 132 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM63CQ9P1W3 806 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L8P0C7I0 530 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP7D2Q96T17 732 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C1D1 291 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMLP26374 656 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 MCAMP43121 646 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRKQ9NRH2 765 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 HMG20BQ9P0W2 317 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM70O94826 608 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO3BQ8WXR4 1341 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCE3A1L190 88 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOZ2Q9NPC6 264 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC11AQ9Y240 323 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM184AQ8NB25 1140 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP11Q9UKA4 1901 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC39AQ5SRH9 613 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY26PQ9H489 355 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX5P30044 214 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC158Q5M9N0 1113 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA5Q8NB90 893 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 UVSSAQ2YD98 709 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF9Q3BBW0 867 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 OGFOD1Q8N543 542 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DLK2Q6UY11 383 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO2Q9NQ90 1003 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3EO15041 775 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR66Q8TBY9 1149 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP350Q5VT06 3117 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM87AQ8NBN3 555 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCF2Q9UG63 623 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.575e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TSHZ3Q63HK5 1081 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 LDHDQ86WU2 507 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT10BO00744 389 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZAP70P43403 619 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA4P34932 840 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP100Q494V2 611 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CHADLQ6NUI6 762 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RILPL2Q969X0 211 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC9Q9UKV0 1011 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB22O15209 634 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF384Q8TF68 577 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PALD1Q9ULE6 856 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP31.08■■■□□ 2.572e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF8P60827 252 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTROBQ8N137 903 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC1BQ8NDV3 1235 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC1I1O14576 645 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 LDHBP07195 334 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CRKP46108 304 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GGA3Q9NZ52 723 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAP2Q9UHJ9 254 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 BOLA2Q9H3K6 86 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF5O00463 557 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DLGAP5Q15398 846 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE2BA6NHP3 402 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE6P0CI01 402 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SASS6Q6UVJ0 657 aa31.04■■■□□ 2.56
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