RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 RASGRF1Q13972 1273 aa25.79■■□□□ 1.72
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CITED1-201ENST00000246139 ALDH1A1P00352 501 aa25.72■■□□□ 1.71
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CITED1-201ENST00000246139 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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CITED1-201ENST00000246139 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.7■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.7■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.69■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 OTUD5Q96G74 571 aa25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.67■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 GAKO14976 1311 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 MECOMQ03112 1051 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED1-201ENST00000246139 RAI14Q9P0K7 980 aa25.66■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 BTDP43251 543 aa25.65■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 PTPN18Q99952 460 aa25.65■■□□□ 1.7
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CITED1-201ENST00000246139 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.63■■□□□ 1.69
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CITED1-201ENST00000246139 LDHCP07864 332 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 GTF2A2P52657 109 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CAP1Q01518 475 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
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