RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Top1mtQ8R4U6 593 aa10.28□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr63B2RY71 923 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tango6Q8C3S2 1079 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atg4aQ8C9S8 396 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trip6Q9Z1Y4 480 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm11983V9GXS8 105 aa10.27□□□□□ -0.76
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ube4aE9Q735 1028 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HalP35492 657 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr162Q3UN16 588 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adora1Q60612 326 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klra4Q60651 263 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Homer1Q9Z2Y3 366 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif3cO35066 796 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem266Q8BZB3 538 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ciao1Q99KN2 339 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 InsrrQ9WTL4 1300 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stox1B2RQL2 990 aa10.27□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr247E9PVJ7 320 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr819K7N727 320 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NapbP28663 298 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdcp1Q5U462 833 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fsd2Q8BZ52 692 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Actn3O88990 900 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ms4a1P19437 291 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccz1Q8C1Y8 480 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pms1Q8K119 917 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Elf2Q9JHC9 593 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clca2Q8BG22 942 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lmbrd2Q8C561 694 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sil1Q9EPK6 465 aa10.26□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp25P57080 1055 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map9Q3TRR0 646 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nlrp9bQ66X22 1003 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eif6O55135 245 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plbd2Q3TCN2 594 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp4r3bQ922R5 820 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45015A0A140LII9 184 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm18336A0A140LIU8 765 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ets1P27577 440 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cnnm3Q32NY4 713 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ErfeQ6PGN1 340 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmco3Q8BH01 678 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rec8Q8C5S7 591 aa10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mapkapk5O54992 473 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pla2g4fQ50L41 855 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 March6Q6ZQ89 909 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EngaseQ8BX80 734 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q8C6G1 249 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp19a1P28649 503 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adcy2Q80TL1 1090 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Anapc4Q91W96 807 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NagaQ9QWR8 415 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scp2P32020 547 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp6v1dP57746 247 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Npdc1Q64322 332 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Susd4Q8BH32 490 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Izumo3A6PWV3 263 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Snai1Q02085 264 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cfap157Q0VFX2 523 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arid3aQ62431 601 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trak2Q6P9N8 913 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AidaQ8C4Q6 305 aa10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Magea1O89006 320 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Magea5O89009 320 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam198bQ3UPI1 517 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vps54Q5SPW0 977 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k12Q60700 888 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scaf8Q6DID3 1268 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Magea2Q9R2A2 320 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abca3Q8R420 1704 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sp4Q62445 782 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Themis2Q91YX0 663 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hmgn5Q9JL35 406 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abcc4E9Q236 1325 aa10.23□□□□□ -0.77
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrc1Q61830 1456 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 115.4 ms