RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637121.1

EFHC1-228, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 3

Gene EFHC1, Length 2,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-228	ENST00000637121	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	TCF21	O43680	179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	TOMM40	O96008	361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	CRYGB	P07316	175 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	NBL1	P41271	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	BMPR1B	O00238	502 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	PMCH	P20382	165 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SRI	P30626	198 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	LINC00310	P59036	64 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121		Q6AWC8	147 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-228	ENST00000637121	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A8MZ25	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HSBP1	O75506	76 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LTA	P01374	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PLA2G5	P39877	138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	REG1B	P48304	166 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MFAP2	P55001	183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HBB	P68871	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	VAMP3	Q15836	100 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TNXA	Q16473	311 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RPE	Q96AT9	228 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A0A1W2PS18	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		E7EQL1	145 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SNAI2	O43623	268 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NUPR1	O60356	82 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		P01737	135 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	GP9	P14770	177 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FXYD3	Q14802	87 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MMD	Q15546	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A0A1B0GXF2	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PGP	A6NDG6	321 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		E7EUB6	86 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TCRA	P04437	139 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PYY	P10082	97 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ORM2	P19652	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PDE6H	Q13956	83 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MLANA	Q16655	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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