RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	DLEU1	O43261	78 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF253	O75346	499 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	AMY1A	P04745	511 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	LIPF	P07098	398 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SLA	Q13239	276 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	BMPR1B	O00238	502 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND6	P03923	174 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PMCH	P20382	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	MYCNOS	P40205	109 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	CAMP	P49913	170 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PAFAH1B2	P68402	229 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HES1	Q14469	280 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152		Q0VG73	95 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	APCS	P02743	223 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	GP9	P14770	177 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HTR1D	P28221	377 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152		Q9H3A6	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DQA1	P01909	254 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	AMT	P48728	403 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	FBLN7	Q53RD9	439 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BRF1-222	ENST00000635152	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		M0R143	59 aa		10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	BRS3	P32247	399 aa		10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KRTDAP	P60985	99 aa		10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.4	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		I3L2K1	104 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ESD	P10768	282 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GPR82	Q96P67	336 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ASCL2	Q99929	193 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GPX1	P07203	203 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KLRB1	Q12918	225 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	BATF	Q16520	125 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PS18	150 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TCRA	P04437	139 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	NTF3	P20783	257 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	COTL1	Q14019	142 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		K7EIM0	57 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	NBR2	O15453	112 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	COX19	Q49B96	90 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFS7	O75251	213 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KCNS1	Q96KK3	526 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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