RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	GPR12	P47775	334 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	UQCRFS1	P47985	274 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	HCFC1	P51610	2035 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	HBB	P68871	147 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	SPINK9	Q5DT21	86 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01545	Q5VT33	79 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BBS1-225	ENST00000630659		A0A087X0K7	114 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	SIVA1	O15304	175 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FOXH1	O75593	365 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	PLP1	P60201	277 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	SIGMAR1	Q99720	223 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659		J3QR89	54 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFB3	O43676	98 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF134	P52741	427 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	CT83	Q5H943	113 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FA2H	Q7L5A8	372 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		12.33	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	GGTLC3	B5MD39	225 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	APOA2	P02652	100 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	HSD52	Q0P140	79 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V0B	Q99437	205 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0G2JLM5	398 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00473	A8K010	186 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	PROP1	O75360	226 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-7	P01780	117 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf159	Q96HA4	380 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FCN3	O75636	299 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	COL8A2	P25067	703 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	MTURN	Q8N3F0	131 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LEAP2	Q969E1	77 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	NABP2	Q9BQ15	211 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	HIGD1C	A8MV81	97 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	C8orf88	P0DMB2	117 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	UTF1	Q5T230	341 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ENY2	Q9NPA8	101 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		12.3	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00205	P59089	165 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	TCF19	Q9Y242	345 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPM0	123 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659		H3BUT2	72 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FSTL3	O95633	263 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	LYNX1	P0DP58	116 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	FABP2	P12104	132 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF714	Q96N38	554 aa		12.29	□□□□□ -0.44
BBS1-225	ENST00000630659	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		12.29	□□□□□ -0.44

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