RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	IL5	P05113	134 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	ORM2	P19652	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	VAMP2	P63027	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PNKP-223	ENST00000629179	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	BCAP31	P51572	246 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	IL15RA	Q13261	267 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	RARRES2	Q99969	163 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DOK5	Q9P104	306 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DEFB1	P60022	68 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	S100A10	P60903	97 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	RAB32	Q13637	225 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SOCS3	O14543	225 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DEDD	O75618	318 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	CST7	O76096	145 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SIX6	O95475	246 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00869	P0C866	280 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	C4BPB	P20851	252 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	ID1	P41134	155 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	CAV2	P51636	162 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179		H3BMM0	161 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179		H3BRN7	92 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	HYPM	O75409	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	OR5G3	P0C626	314 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SPP1	P10451	314 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GALR1	P47211	349 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PLP1	P60201	277 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SELENOT	P62341	195 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	GOSR2	O14653	212 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	AGPAT2	O15120	278 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PSMB3	P49720	205 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DEFA1	P59665	94 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DEFA3	P59666	94 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	RAP2B	P61225	183 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	ISLR	O14498	428 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	DEFB4A	O15263	64 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	PRAF2	O60831	178 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	S100A7	P31151	101 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	MGST2	Q99735	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.33	□□□□□ -0.75
PNKP-223	ENST00000629179	LCE6A	A0A183	80 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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