RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ORM2P19652 201 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF616Q08AN1 781 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 LEMD1Q68G75 181 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD1Q8N668 190 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 DPF1Q92782 380 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CITED1Q99966 193 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 GGACTQ9BVM4 153 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ARV1Q9H2C2 271 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A22Q9H936 323 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FNDC10F2Z333 226 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01619G3V211 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TAAR5O14804 337 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 JTBO76095 146 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SPP1P10451 314 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 B2MP61769 119 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF266Q14584 549 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF726P1Q15940 193 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RPEL1Q2QD12 228 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC51BQ86UW2 128 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BAP18Q8IXM2 172 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf56Q8N813 242 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF709Q8N972 641 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8WTZ3 238 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TXN2Q99757 166 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.59□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUS0 222 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM213A2RRL7 107 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 COX7A2P2O60397 106 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 LCN15Q6UWW0 184 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 STOML3Q8TAV4 291 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF125Q96EQ8 232 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF747Q9BV97 191 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RPRMQ9NS64 109 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BRN7 92 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OVOL1O14753 267 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 MPDU1O75352 247 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 HYPMO75409 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PF4P02776 101 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10J4P0C629 311 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PYYP10082 97 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCNOSP40205 109 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB31Q13636 194 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 FHL3Q13643 280 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM78BQ5VT40 261 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZRG5 221 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF503Q96F45 646 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf77Q96MU5 243 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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