RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CACNG5Q9UF02 275 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf84H3BNL1 204 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SCGB2A1O75556 95 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 P0C879 139 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TFPI2P48307 235 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IL15RAQ13261 267 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SMCO1Q147U7 214 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 DNLZQ5SXM8 178 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 OR52E5Q8NH55 327 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 MUC7Q8TAX7 377 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GINS3Q9BRX5 216 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TREM1Q9NP99 234 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SMPXQ9UHP9 88 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 OR4C46A6NHA9 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 WRBO00258 174 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM50AO95807 157 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 BMI1P35226 326 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1A2P50226 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SSTP61278 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PAFAH1B2P68402 229 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R1AQ13522 171 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM187Q14656 261 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 MLANAQ16655 118 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LGI3Q8N145 548 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IL22RA2Q969J5 263 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM230Q96A57 120 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT14Q96FL9 552 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RETNQ9HD89 108 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 H0YIZ8 118 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 CHEK1O14757 476 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SFT2D2O95562 160 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA10P01566 189 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 VAMP1P23763 118 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SRPXP78539 464 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 OR10C1Q96KK4 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf50Q96LR7 162 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 RNF2Q99496 336 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 ARV1Q9H2C2 271 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf51A6NDU8 294 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 CCSO14618 274 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 CLN5O75503 358 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 PET100P0DJ07 73 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 NPPCP23582 126 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 NPY1RP25929 384 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf83Q53S99 150 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 TCF24Q7RTU0 167 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 OR4X1Q8NH49 305 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 TMED6Q8WW62 240 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 NIT2Q9NQR4 276 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GU03 582 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PS18 150 aa6.2□□□□□ -1.42
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