RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	C4BPB	P20851	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	ID1	P41134	155 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	PSMB3	P49720	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	DLK1	P80370	383 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	RYR2	Q92736	4967 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKD1-231	ENST00000566784	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		A6NHS1	94 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		H3BMM0	161 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SOCS3	O14543	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ISLR	O14498	428 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CCS	O14618	274 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CCNK	O75909	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ORM2	P19652	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	GALR1	P47211	349 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MEOX2	P50222	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	PLP1	P60201	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SELENOT	P62341	195 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ASAH1	Q13510	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	GPR82	Q96P67	336 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		K7EPK0	472 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	IL5	P05113	134 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MIF	P14174	115 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		Q8NAQ8	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		H3BRN7	92 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	LINC00869	P0C866	280 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		X6R8D5	127 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784		L7N2F9	121 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	HYPM	O75409	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	DEDD	O75618	318 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	UPK1B	O75841	260 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	RAP2B	P61225	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	VAMP2	P63027	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	S100A7A	Q86SG5	101 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PKD1-231	ENST00000566784	DEFB4A	O15263	64 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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