RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM86B	Q8N661	226 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LFNG	Q8NES3	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	F8	P00451	2351 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		M0QZK8	103 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SSSCA1	O60232	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MED6	O75586	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	DEDD	O75618	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGHG2	P01859	326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C1QB	P02746	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PRH1	P02810	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RLN2	P04090	185 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	REG1A	P05451	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A4	P12235	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MFAP2	P55001	183 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	DSCR10	P59022	87 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HERV-K104	P63124	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IFITM2	Q01629	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF546	Q86UE3	836 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	DTD1	Q8TEA8	209 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR4C12	Q96R67	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF23	A1L1A6	192 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		H3BP45	60 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		L7N2F9	121 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ARPC5	O15511	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SOX15	O60248	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CST7	O76096	145 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IFNA10	P01566	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGF1	P05019	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CRYGC	P07315	174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CTRB1	P17538	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL2	P19875	107 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	P2RY1	P47900	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CAV2	P51636	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R30	P59541	319 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	FGL1	Q08830	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SCGB2A2	Q13296	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZRG5	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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