RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF503Q96F45 646 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 UPK3BQ9BT76 320 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 DOK5Q9P104 306 aa4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CTDSP2-208ENST00000552294 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZQT7 251 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.58□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SAMD12Q8N8I0 201 aa4.58□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.58□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 DIABLOQ9NR28 239 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 CACNG5Q9UF02 275 aa4.58□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0A6YYH2 397 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GAGE12BA1L429 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 A6NJ64 397 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 PRAC2D3DTV9 90 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 ISLRO14498 428 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GAGE7O76087 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 CD3DP04234 171 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR5AC1P0C628 307 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GAGE12FP0CL80 117 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 PGAM2P15259 253 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 PRSS3P35030 304 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 TAS2R46P59540 309 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SPCS3P61009 180 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 RND3P61587 244 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 WFDC2Q14508 124 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 ODF1Q14990 250 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 MARCH1Q8TCQ1 289 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC01587Q99440 93 aa4.57□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 SSR3Q9UNL2 185 aa4.57□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A1W2PPQ1 181 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 CORTO00230 105 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 INSP01308 110 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 M6PRP20645 277 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 GCSHP23434 173 aa4.56□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 LINC01620Q4KN68 170 aa4.56□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf92Q96LL3 132 aa4.56□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 RBKSQ9H477 322 aa4.56□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A22Q9H936 323 aa4.56□□□□□ -1.68
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CTDSP2-208ENST00000552294 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 PRSS46E5RG02 174 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 H3BTX0 84 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 HPGDSO60760 199 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 NXPH4O95158 308 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 CDS2O95674 445 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A4P12235 298 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 ID1P41134 155 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 SCAND1P57086 179 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSP2-208ENST00000552294 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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