RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		M0R1W7	72 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		M0R1X1	148 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SYNGR2	O43760	224 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NTF3	P20783	257 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		Q56UQ5	140 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IL36G	Q9NZH8	169 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		H0Y980	276 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	RHBDL1	O75783	438 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TFF1	P04155	84 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PSG2	P11465	335 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	GPM6A	P51674	278 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM42	Q69YG0	159 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	CITED1	Q99966	193 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NPFF	O15130	113 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	DHRS3	O75911	302 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00869	P0C866	280 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A6	P12236	298 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SRI	P30626	198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PSG3	Q16557	428 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	HCP5	Q6MZN7	132 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		K7EN84	100 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	BMPR1B	O00238	502 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	MT-ND6	P03923	174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	AZU1	P20160	251 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	S100G	P29377	79 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2E1	P51965	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	DLX1	P56177	255 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PROK1	P58294	105 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	KLRD1	Q13241	179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V0B	Q99437	205 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	HES4	Q9HCC6	221 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PSG11	Q9UQ72	335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		J3QT63	122 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NPY1R	P25929	384 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	MC5R	P33032	325 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SSTR5	P35346	364 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	RPEL1	Q2QD12	228 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984		Q6ZSV7	163 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	C7orf71	A4D174	169 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SYNGR1	O43759	233 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	SPINK4	O60575	86 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PDCD6	O75340	191 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FGD4-215	ENST00000551984	HAND1	O96004	215 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms