RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 CCDC140Q96MF4 163 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-209ENST00000547449 PTPN13Q12923 2485 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 HELTA6NFD8 242 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ZNF98A6NK75 572 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 GGTLC3B5MD39 225 aa7.58□□□□□ -1.2
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CS-209ENST00000547449 CD5LO43866 347 aa7.58□□□□□ -1.2
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CS-209ENST00000547449 GPR183P32249 361 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TAS2R60P59551 318 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ZNF329Q86UD4 541 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TMEM86BQ8N661 226 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 A0A0G2JLM5 398 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CLDN34H7C241 214 aa7.57□□□□□ -1.2
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CS-209ENST00000547449 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CD99P14209 185 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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CS-209ENST00000547449 RANP62826 216 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ADIRFQ15847 76 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 LEMD1Q68G75 181 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 LINC01551Q86U37 167 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 YPEL4Q96NS1 127 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 DERL1Q9BUN8 251 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 OTORQ9NRC9 128 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RABAC1Q9UI14 185 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 EPDR1Q9UM22 224 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PGPA6NDG6 321 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 IGHG4P01861 327 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 IGLC2P0DOY2 106 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TPPP2P59282 170 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 RNF212Q495C1 297 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 FAM209BQ5JX69 171 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 OCC1Q8TAD7 63 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 BLNKQ8WV28 456 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ISOC2Q96AB3 205 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 KLK15Q9H2R5 256 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 LRBAP50851 2863 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.22e-7■■□□□ 11.4
CS-209ENST00000547449 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PEX7O00628 323 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PPP1R2P9O14990 202 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PF4V1P10720 104 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 FOLR2P14207 255 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PDE6HQ13956 83 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 Q8N2B8 174 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 Q9H3A6 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ZNF702PQ9H963 129 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 U3KQE9 123 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 H7BYZ3 331 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 BUB3O43684 328 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 PSMB8P28062 276 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ARL3P36405 182 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 GNG4P50150 75 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 ELOBQ15370 118 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-209ENST00000547449 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.54□□□□□ -1.2
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