RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	LYZ	P61626	148 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	OR2F1	Q13607	317 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	GAMT	Q14353	236 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	GLMP	Q8WWB7	406 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	RNF125	Q96EQ8	232 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	BUB3	O43684	328 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	MIF	P14174	115 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	S100A7	P31151	101 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	RAB14	P61106	215 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF90	Q03938	601 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	DCANP1	Q8TF63	244 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	XCL2	Q9UBD3	114 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.11	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C11orf94	C9JXX5	98 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SFT2D2	O95562	160 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	IFNA21	P01568	189 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	HLA-DMB	P28068	263 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TCTA	P57738	103 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TRIQK	Q629K1	86 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	NUDT15	Q9NV35	164 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120		A0A1B0GVG6	124 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SMCO3	A2RU48	225 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	CENPX	A8MT69	81 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120		H3BMM0	161 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SYNGR2	O43760	224 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SLC25A6	P12236	298 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	ORM2	P19652	201 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	M6PR	P20645	277 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C4BPB	P20851	252 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	EMP1	P54849	157 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	FXYD7	P58549	80 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	AKR1C1	Q04828	323 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	PPP1R1A	Q13522	171 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	LCE2C	Q5TA81	110 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	LRTM2	Q8N967	370 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120		Q8NAQ8	132 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	TRGV9	Q99603	122 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SPX	Q9BT56	116 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	SLC25A22	Q9H936	323 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.09	□□□□□ -1.43
DDB1-208	ENST00000537120	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	PITX3	O75364	302 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	DEDD	O75618	318 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	GALR1	P47211	349 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	FGL1	Q08830	312 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	RSG1	Q9BU20	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120		V9GYH0	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.07	□□□□□ -1.44
DDB1-208	ENST00000537120	XKRY2	A2RUG3	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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