RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PAX9P55771 341 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF124Q15973 351 aa8.53□□□□□ -1.04
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UBASH3B-208ENST00000533451 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 LEMD1Q68G75 181 aa8.53□□□□□ -1.04
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UBASH3B-208ENST00000533451 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.53□□□□□ -1.04
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UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB131AP59861 70 aa8.52□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A22Q9H936 323 aa8.52□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXL17Q9UF56 701 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 U3KQE9 123 aa8.51□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 K7EQG2 157 aa8.5□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 RLN2P04090 185 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A7P31151 101 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 RAP2BP61225 183 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 HBG2P69892 147 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL16Q0P5N6 197 aa8.5□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 NRN1Q9NPD7 142 aa8.5□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PTTG1O95997 202 aa8.49□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 SULT1A1P50225 295 aa8.49□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF546Q86UE3 836 aa8.49□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00052Q96N35 136 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL6Q9H0F7 186 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 KNCNA6PVL3 124 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 HYPMO75409 117 aa8.48□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.48□□□□□ -1.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 GGACTQ9BVM4 153 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 NMES1Q9C002 83 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ALG5Q9Y673 324 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF98A6NK75 572 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 E5RGE8 158 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 FNDC10F2Z333 226 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 AGPAT2O15120 278 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 COX7A2P2O60397 106 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PET100P0DJ07 73 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A11P31949 105 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CAMLGP49069 296 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 H2BFSP57053 126 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A7AQ86SG5 101 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.47□□□□□ -1.05
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