RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 COPZ2Q9P299 210 aa3.1□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.1□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.09□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 GABARAPO95166 117 aa3.09□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 MIFP14174 115 aa3.09□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1C4P17516 323 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R20P59543 309 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.09□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.09□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 U3KQ87 197 aa3.09□□□□□ -1.91
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HDAC2-216ENST00000523628 SSX5O60225 188 aa3.08□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CLN5O75503 358 aa3.08□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 YIF1AO95070 293 aa3.08□□□□□ -1.92
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HDAC2-216ENST00000523628 SMPXQ9UHP9 88 aa3.08□□□□□ -1.92
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HDAC2-216ENST00000523628 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T8A6NH00 312 aa3.07□□□□□ -1.92
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HDAC2-216ENST00000523628 K7EIM0 57 aa3.07□□□□□ -1.92
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HDAC2-216ENST00000523628 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.07□□□□□ -1.92
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HDAC2-216ENST00000523628 P0DMU3 169 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FAM231AP0DMU4 169 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FAM231CP0DMU5 169 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 AREGP15514 252 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CRYBB3P26998 211 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OPRK1P41145 380 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LPAR6P43657 344 aa3.07□□□□□ -1.92
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