RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-16P04430 117 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 MYOD1P15172 320 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SERF2P84101 59 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 VSIRQ9H7M9 311 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WX48 190 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 OPRK1P41145 380 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 LOXL3P58215 753 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TFF3Q07654 80 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 BAGE3Q86Y29 109 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 BAGE2Q86Y30 109 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 OR9G1Q8NH87 305 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 PRNDQ9UKY0 176 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 REG1AP05451 166 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GPX1P07203 203 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 A6NDN8 102 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf118A6NHY6 69 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 RRHO14718 337 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK8P0C7L1 97 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CRISP2P16562 243 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GNLYP22749 145 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TNXAQ16473 311 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 PERPQ96FX8 193 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE12JA6NER3 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZZEF1O43149 2961 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE7O76087 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 KBTBD11O94819 623 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE12FP0CL80 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE12GP0CL81 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE12IP0CL82 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SEC11AP67812 179 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE4Q13068 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 MIC13Q5XKP0 118 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 Q8TCH9 128 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NRN1Q9NPD7 142 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 POLQO75417 2590 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 PROP1O75360 226 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 IGFBP2P18065 325 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CA2P00918 260 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 UQCRFS1P47985 274 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 HCP5Q6MZN7 132 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TEPPQ6URK8 271 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00869P0C866 280 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 AREGP15514 252 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 Q0VG73 95 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CTSZQ9UBR2 303 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf61A6NNL5 157 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 H3BRM9 83 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 PAGE4O60829 102 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CT45A6P0DMU7 189 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CT45A5P0DMU8 189 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CT45A7P0DMV0 189 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms