RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515885.5

LINC00461-216, long intergenic non-protein coding RNA 461, human

TSL 5

Gene LINC00461, Length 719 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00461-216	ENST00000515885	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00461-216	ENST00000515885	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	S100A6	P06703	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	CCL1	P22362	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	FLOT2	Q14254	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	GAPT	Q8N292	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RTL8C	O15255	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	COX4I1	P13073	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	PSME3	P61289	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	DEFA5	Q01523	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885		Q96MT0	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885		H3BUA1	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	AIP	O00170	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ORC5	O43913	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	NDUFA3	O95167	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	CA2	P00918	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	LGALS7	P47929	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ZNF137P	P52743	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	DSCR10	P59022	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	CD164	Q04900	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RAB31	Q13636	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RSU1	Q15404	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TRAM1	Q15629	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	LGI3	Q8N145	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	GPER1	Q99527	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TBX5	Q99593	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	TALDO1	P37837	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ERCC8	Q13216	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	FXYD3	Q14802	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	PHB2	Q99623	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00461-216	ENST00000515885	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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