RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 TAS2R60P59551 318 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 RHOBP62745 196 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 AMTNQ6UX39 209 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SSR3Q9UNL2 185 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 ZFP92A6NM28 416 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SDC2P34741 201 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GALR1P47211 349 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SPCS3P61009 180 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 LYZP61626 148 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAMTQ14353 236 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 BSXQ3C1V8 233 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 C2orf83Q53S99 150 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 NOXA1Q86UR1 476 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 C20orf173Q96LM9 149 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAGE12BA1L429 117 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 H3BNG1 76 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAGE7O76087 117 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 FABP1P07148 127 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAGE12FP0CL80 117 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAGE12GP0CL81 117 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 GAGE12IP0CL82 117 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 RSG1Q9BU20 258 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COPB2-208ENST00000512153 ZNF98A6NK75 572 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 NXPH3O95157 252 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 NXPH4O95158 308 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 RLN2P04090 185 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 ELK1P19419 428 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 HOXA5P20719 270 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 PRSS3P35030 304 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 UCP3P55916 312 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 FGL1Q08830 312 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 TP53RKQ96S44 253 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SLC25A22Q9H936 323 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 A8MTW9 85 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 GABARAPH6UMI1 98 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 GABARAPO95166 117 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 P0C879 139 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 NAT1P18440 290 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 PI3P19957 117 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 RCVRNP35243 200 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 PIGPP57054 158 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 ZNF90Q03938 601 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 OR2F1Q13607 317 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SP6Q3SY56 376 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 ZNF738Q8NE65 137 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 A0A096LPF7 62 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SNURFLB1AK76 121 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 OR52E5Q8NH55 327 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 COPZ2Q9P299 210 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 A0A0G2JRQ6 117 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 H7BYZ3 331 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 PSCAO43653 123 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 RND3P61587 244 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 FAM219AQ8IW50 185 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 RNF182Q8N6D2 247 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SLC35E1Q96K37 410 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-208ENST00000512153 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms