RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 H3BP45 60 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEA5P43359 124 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 RFESDQ8TAC1 157 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 BRK1Q8WUW1 75 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LIME1Q9H400 295 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PEMTQ9UBM1 199 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HTTP42858 3142 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf51A8MQB3 221 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NPYP01303 97 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GLI4P10075 376 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2D3P61077 147 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2D2P62837 147 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GPHA2Q96T91 129 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TCL1BO95988 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PRNPP04156 253 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SRYQ05066 204 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF56Q15929 161 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01553A4QN01 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01548A6NM66 108 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ATOX1O00244 68 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A20O43772 301 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LYPD3O95274 346 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ELANEP08246 267 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FXYD3Q14802 87 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PDPNQ86YL7 162 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 Q8N1Y9 231 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf92Q96LL3 132 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRDP23468 1912 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PLXNA2O75051 1894 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 P01737 135 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CRYGSP22914 178 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 EFNA4P52798 201 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FXYD4P59646 89 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 BORCS8Q96FH0 119 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H4GQ99525 98 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PSENENQ9NZ42 101 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LTAP01374 205 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 DLX1P56177 255 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ERVK-16P61578 105 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 FHL1Q13642 323 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 OR5AS1Q8N127 324 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A45Q8N413 288 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LTBP1Q14766 1721 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MGST3O14880 152 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LYZL6O75951 148 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 BGLAPP02818 100 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CENPWQ5EE01 88 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IER5LQ5T953 404 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MGST2Q99735 147 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 DYSFO75923 2080 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01619G3V211 115 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS9O00182 355 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 NPC2P61916 151 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CYYR1Q96J86 154 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MGAMO43451 1857 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRBP23467 1997 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 CCL5P13501 91 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-216ENST00000507116 HERVK_113P61574 105 aa4.93□□□□□ -1.62
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