RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		B9A039	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		M0R143	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PEX7	O00628	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GPX1	P07203	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CRYGB	P07316	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MYOD1	P15172	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CCL3L1	P16619	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PRSS8	Q16651	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NRGN	Q92686	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RND1	Q92730	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CAD	P27708	2225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	POLE	Q07864	2286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1W2PPI3	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NUPR1	O60356	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HYPM	O75409	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SERF1A	O75920	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2J3	O76001	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	APCS	P02743	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HNF1A	P20823	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	OR5I1	Q13606	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		Q6ZWC4	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CCL17	Q92583	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GPR82	Q96P67	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	RELN	P78509	3460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TNC	P24821	2201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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