RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 TCF24Q7RTU0 167 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF709Q8N972 641 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF414Q96IQ9 312 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF2Q99496 336 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 MGST2Q99735 147 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5SQ99766 215 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 ARPC5O15511 151 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 COX7A2P2O60397 106 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 HYPMO75409 117 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf88P0DMB2 117 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 LYL1P12980 280 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A7P31151 101 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 VWC2Q2TAL6 325 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 ARL6Q9H0F7 186 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A22Q9H936 323 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 MPDU1O75352 247 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYBB3P26998 211 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZRG5 221 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A7AQ86SG5 101 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXL17Q9UF56 701 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 CD81P60033 236 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 PAFAH1B2P68402 229 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 MIC13Q5XKP0 118 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP14Q86UN6 197 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 STPG3Q8N7X2 389 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 MRAPQ8TCY5 172 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 AQP10Q96PS8 301 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-204ENST00000503638 HELTA6NFD8 242 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4C46A6NHA9 309 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 CD5P06127 495 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 B2MP61769 119 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 UHRF2Q96PU4 802 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 MFFQ9GZY8 342 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 VSIRQ9H7M9 311 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPAN4O14817 238 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF266Q14584 549 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 OPCMLQ14982 345 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 LEMD1Q68G75 181 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 ARV1Q9H2C2 271 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GVG6 124 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF785A8K8V0 405 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 BUB3O43684 328 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 C16orf54Q6UWD8 224 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 PFDN5Q99471 154 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 NEURL2Q9BR09 285 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 RSG1Q9BU20 258 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 WFDC1Q9HC57 220 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF222A6NCQ9 220 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF98A6NK75 572 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 G3V3Q6 166 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 K7EIL1 84 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 CD7P09564 240 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 GALR1P47211 349 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 GLMPQ8WWB7 406 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-204ENST00000503638 TUBA4BQ9H853 241 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms