RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549		F5H768	121 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGST3	O14880	152 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A20	O43772	301 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM42	Q69YG0	159 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YW62	118 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R3E3	92 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPFF	O15130	113 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	VWC2L	B2RUY7	222 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA3	O95167	84 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPY	P01303	97 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMVK	Q15126	192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		E9PLN8	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	HAX1	O00165	279 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAU	P00749	431 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DLX1	P56177	255 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	FXYD7	P58549	80 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	YPEL5	P62699	121 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDIP1	Q9H305	208 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	TET1	Q8NFU7	2136 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUX1	O43812	170 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCR2	O95944	276 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUX5	Q96PT3	197 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLN	P26678	52 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DKK2	Q9UBU2	259 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF815P	A8K554	130 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BMM0	161 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PYY	P10082	97 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF6	P10767	208 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXC1	Q12948	553 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6Q795	121 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPC4	97 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYNGR3	O43761	229 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	LTA	P01374	205 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV3-1	P01715	115 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAC	P01848	142 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G5	P39877	138 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DDB2	Q92466	427 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0Y8X5	98 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRAP	Q8TCY5	172 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GXF2	115 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFRA3	O60609	400 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-9	P01782	118 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV3-11	P04433	115 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRD5A1	P18405	259 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLRB1	Q12918	225 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFS7	O75251	213 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSR4	P51571	173 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZR03	302 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		B9A039	149 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EMI3	77 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF329	Q86UD4	541 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A096LPE4	126 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPZ6	126 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK2	P20155	84 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	RND1	Q92730	232 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	DYSF	O75923	2080 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	REV3L	O60673	3130 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		6.65	□□□□□ -1.35

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