RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 LYZP61626 148 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8WTZ3 238 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF702PQ9H963 129 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2T8A6NH00 312 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PAGE4O60829 102 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2C1O95371 312 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TGP01266 2768 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PF4V1P10720 104 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ADCYAP1P18509 176 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TPPP2P59282 170 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A7AQ86SG5 101 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8N2B8 174 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 C3orf56Q8N813 242 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SUN5Q8TC36 379 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC140Q96MF4 163 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0G2JLM5 398 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TGOLN2O43493 480 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR7C2O60412 319 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHG4P01861 327 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 APOC3P02656 99 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 IL4P05112 153 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC3BP05452 202 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR183P32249 361 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ADMP35318 185 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 MORN5Q5VZ52 161 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF125Q96EQ8 232 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF503Q96F45 646 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 UHRF2Q96PU4 802 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR51M1Q9H341 326 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.32□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BRN7 92 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CLDN34H7C241 214 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A7P31151 101 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB9AP51151 201 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CD81P60033 236 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC35B1P78383 322 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX5Q96PT3 197 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PAXXQ9BUH6 204 aa8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM74A7A6NL05 159 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf94C9JXX5 98 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 F6UZH7 168 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM250H0YL14 139 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ELANEP08246 267 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMB8P28062 276 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2G2P60604 165 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM209BQ5JX69 171 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CST9LP1Q5W188 147 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 SVBPQ8N300 66 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4F5Q8NH21 305 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4F4Q96R69 305 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 KLK15Q9H2R5 256 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 GNB4Q9HAV0 340 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF24Q9Y225 148 aa8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PRE2 83 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 BMPR1BO00238 502 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PDE6DO43924 150 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10J4P0C629 311 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 PYYP10082 97 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL3P36405 182 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 FOXE3Q13461 319 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 GUCA2BQ16661 112 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX38Q6PEX7 206 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF329Q86UD4 541 aa8.29□□□□□ -1.08
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms