RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.85□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 TCL1AP56279 114 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LOXL3P58215 753 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCR9P59020 149 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF726P1Q15940 193 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TSKUQ8WUA8 353 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RCHY1Q96PM5 261 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIN2AQ99865 258 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RELNP78509 3460 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WX48 190 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 VWC2LB2RUY7 222 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ISLRO14498 428 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFS7O75251 213 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 DLX6P56179 175 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LCN12Q6JVE5 192 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NRGNQ92686 78 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2D2Q9H210 308 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 IL36BQ9NZH7 164 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG12Q9UBI6 72 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf98A8MV24 154 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF90Q03938 601 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 KLRD1Q13241 179 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 Q56UQ5 140 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FGFRL1Q8N441 504 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RFESDQ8TAC1 157 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 UBALD1Q8TB05 177 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SNURFLB1AK76 121 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXH1O75593 365 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM50AO95807 157 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS4P56470 323 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF525Q8N782 197 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4F5Q8NH21 305 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM168AQ92567 244 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LHX4Q969G2 390 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12JA6NER3 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C46A6NHA9 309 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R1W7 72 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE7O76087 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV2-14P01704 120 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12FP0CL80 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12GP0CL81 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12IP0CL82 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE4Q13068 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 POU2AF1Q16633 256 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00311Q8N616 119 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 DRAM1Q8N682 238 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.83□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087X0K7 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SMARCE1-211ENST00000493660 OR9G9P0C7N8 305 aa5.82□□□□□ -1.48
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