RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 AGPAT2O15120 278 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 CD5P06127 495 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 ZNF688P0C7X2 276 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 LINC00869P0C866 280 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 SULT1A1P50225 295 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 FCN2Q15485 313 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 TEPPQ6URK8 271 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 PATE2Q6UY27 113 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 AGRNO00468 2067 aa8.96□□□□□ -0.97
NISCH-210ENST00000488157 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 MPC2O95563 127 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 RLN2P04090 185 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 RGS21Q2M5E4 152 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 C17orf77Q96MU5 243 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 UHRF2Q96PU4 802 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 GGACTQ9BVM4 153 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A22Q9H936 323 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 HELTA6NFD8 242 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ZNF98A6NK75 572 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 E5RGE8 158 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OR5G3P0C626 314 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 DEFB1P60022 68 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PLP1P60201 277 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 VWC2Q2TAL6 325 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ARL6Q9H0F7 186 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ZMAT4Q9H898 229 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 KNCNA6PVL3 124 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 H3BRN7 92 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 HYPMO75409 117 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 S100A11P31949 105 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SELENOTP62341 195 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OXA1LQ15070 435 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 Q5BKY6 102 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 MORN5Q5VZ52 161 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 MIC13Q5XKP0 118 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 STX12Q86Y82 276 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SPATA25Q9BR10 227 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 MED28Q9H204 178 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 NRN1Q9NPD7 142 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 MBD2Q9UBB5 411 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 TENM3Q9P273 2699 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 FGF7P21781 194 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 CAMLGP49069 296 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 BAXQ07812 192 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 CLINT1Q14677 625 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PSMG4Q5JS54 123 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ZNF546Q86UE3 836 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 THAP6Q8TBB0 222 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ARV1Q9H2C2 271 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SOCS3O14543 225 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 RAP2BP61225 183 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 HBG1P69891 147 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 HBG2P69892 147 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRR20EP86478 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRR20CP86479 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRR20DP86480 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRR20BP86481 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRR20AP86496 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ATP6V1FQ16864 119 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 RSG1Q9BU20 258 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 LYL1P12980 280 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 OPCMLQ14982 345 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 DEFB135Q30KP9 77 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-210ENST00000488157 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms