RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV3-20P01619 116 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R60P59551 318 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ISLRO14498 428 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5G3P48201 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ATG101Q9BSB4 218 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 VSIRQ9H7M9 311 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SYT8Q8NBV8 401 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ODF3BA8MYP8 253 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 MFAP2P55001 183 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IL15RAQ13261 267 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 FA2HQ7L5A8 372 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N9W7 124 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 LINC01619G3V211 115 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SYNJ2BPP57105 145 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RRN3P1Q2M238 152 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 AARDQ4LEZ3 155 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 EPDR1Q9UM22 224 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GUS0 222 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 OVOL1O14753 267 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RNF212Q495C1 297 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM86BQ8N661 226 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV2-14P01704 120 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 CD5LO43866 347 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 HSBP1O75506 76 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RAB5AP20339 215 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZPA2 131 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 STHQ8IWL8 128 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ISOC2Q96AB3 205 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFA4O00483 81 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFA3O95167 84 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 BLCAPP62952 87 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NTF3P20783 257 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PCSK5Q92824 1860 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 MBD6Q96DN6 1003 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf30Q96GV9 206 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPR1 153 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 CD33P20138 364 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 CCL20P78556 96 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 NDPQ00604 133 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF292O60281 2723 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 PSMG4Q5JS54 123 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF114Q8NC26 417 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 SFRP2Q96HF1 295 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 RITA1Q96K30 269 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 FOXE3Q13461 319 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 TWIST1Q15672 202 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 ASCL2Q99929 193 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV2-23P01705 113 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 MGPP08493 103 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IGLC1P0CG04 106 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 LEPP41159 167 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 IER3P46695 156 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 FOXL1Q12952 345 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-211ENST00000486161 OR11H1Q8NG94 326 aa6.54□□□□□ -1.36
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