RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 OR4B1Q8NGF8 309 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 DNAH17Q9UFH2 4485 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 IFNA21P01568 189 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF709Q8N972 641 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 SOCS3O14543 225 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PKHD1P08F94 4074 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 MEOX2P50222 304 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 FXYD7P58549 80 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PSG9Q00887 426 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF79Q15937 498 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 LGALS9BQ3B8N2 356 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 TRGV9Q99603 122 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 DKK2Q9UBU2 259 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PAX9P55771 341 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 DEFB1P60022 68 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 RPRMQ9NS64 109 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 A0A1B0GVY2 172 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 MED6O75586 246 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 HBE1P02100 147 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 OR2F1Q13607 317 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 OXA1LQ15070 435 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 FABP12A6NFH5 140 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 M0R2N4 97 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PITX3O75364 302 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A6P12236 298 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 S100A7P31151 101 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 GALR1P47211 349 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 FAM78BQ5VT40 261 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 THAP8Q8NA92 274 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 A0A0J9YX75 114 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 H3BMQ9 156 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 MED14OSP0DP75 135 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 C16orf92Q96LL3 132 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 RTL8CO15255 209 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 IAPPP10997 89 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 AP3S2P59780 193 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 RRN3P1Q2M238 152 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 LRTM2Q8N967 370 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SOSTQ9BQB4 213 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DOK5Q9P104 306 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TNFSF8P32971 234 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 RNF212Q495C1 297 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 GPR82Q96P67 336 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 F6UB75 175 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 HTN3P15516 51 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 VAMP1P23763 118 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 RSG1Q9BU20 258 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A22Q9H936 323 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF98A6NK75 572 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 A8MTW9 85 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SYNGR2O43760 224 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DAD1P61803 113 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 MCFD2Q8NI22 146 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 Q6ZR54 194 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 C20orf173Q96LM9 149 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRN-215ENST00000484986 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 ORM2P19652 201 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRN-215ENST00000484986 B2MP61769 119 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms